Согласно Распоряжению Кабинета Министров Республики Татарстан от 22.05.2024, Филатов Владимир Сергеевич назначен на должность заместителя министра здравоохранения Республики Татарстан – начальника Управления здравоохранения по городу Казани.
Трудовую деятельность начал в 1993 году в Городской клинической больнице № 6 г. Казани, с 1995 по 1997 гг. работал медбратом приемного покоя.
1997-2000 гг. – врач скорой помощи на станции скорой и неотложной медицинской помощи г. Казани.
В 2000 году начал работу в Детской республиканской клинической больнице в качестве врача-нейрохирурга. В 2014 году был назначен заместителем главного врача по хирургической помощи.
В 2021 году был назначен на должность главного врача ГАУЗ «Городская детская больница №1» г. Казани.